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FLIR Science File SDK eignet sich optimal zur Übertragung aufgezeichneter Dateien an MATLAB und andere Datenanalyseprogramme. Durch die Einbeziehung der Funktionen von MATLAB .MEX kann der Benutzer FLIR-Dateien direkt aus MATLAB öffnen. Dies ist eine leistungsstarke Funktion, da der Benutzer damit auf Temperaturdaten von werkseitig kalibrierten Kameras sowie auf die Rohdaten zugreifen kann.